Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC243547.1-201ENST00000415065 408 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LINC01182-202ENST00000510907 2228 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC124319.2-201ENST00000575034 3651 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MED23-202ENST00000368053 2811 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CLIP1-202ENST00000358808 5880 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MAGEE1-201ENST00000361470 3630 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC005538.2-201ENST00000623215 1864 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 HNRNPA1P44-201ENST00000503999 879 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MCC-209ENST00000515367 3844 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CDY4P-201ENST00000418290 1513 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NOS2P3-202ENST00000458685 3328 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LMLN-201ENST00000330198 7043 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 TRHDE-201ENST00000261180 10733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF225-206ENST00000592780 2538 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OR51E1-202ENST00000530215 2942 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LINC00703-202ENST00000454152 2390 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MYO5A-202ENST00000358212 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LAMA3-201ENST00000269217 5671 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ANO2-202ENST00000356134 3717 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 TKTL2-201ENST00000280605 2654 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC122688.4-201ENST00000623279 4394 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 TNIP3-203ENST00000507879 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 FHL1-201ENST00000345434 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF772-201ENST00000343280 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NLRP5-201ENST00000390649 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NLRP5-203ENST00000621651 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms