Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RP1-206ENST00000636932 3649 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF383-208ENST00000590503 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 KRT7-214ENST00000638501 398 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 TMOD3-201ENST00000308580 8255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CDH8-211ENST00000584337 3986 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 IL2RB-201ENST00000216223 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC008555.2-202ENST00000601776 5302 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SLAMF7-211ENST00000621377 2608 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC019055.1-201ENST00000432822 443 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 GAS7-201ENST00000323816 8033 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF304-201ENST00000282286 4202 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 EFHB-201ENST00000295824 2823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 TRIM6-212ENST00000621176 3005 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 FAM196A-202ENST00000522781 4403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF333-201ENST00000292530 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ISX-201ENST00000308700 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 P2RY14-201ENST00000309170 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SLC33A1-202ENST00000392845 9217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ATG4A-203ENST00000372232 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 C1orf27-203ENST00000419367 1900 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LRRC49-203ENST00000443425 3085 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NOS2-201ENST00000313735 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC004148.2-201ENST00000575890 1938 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 VTRNA1-2-201ENST00000365241 89 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.7 ms