Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SKAP1-201ENST00000336915 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CADM2-203ENST00000407528 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RNA5SP250-201ENST00000362534 119 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 FTH1P10-201ENST00000401830 930 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ARF1P1-201ENST00000406466 544 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RN7SKP127-201ENST00000410443 354 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RN7SKP42-201ENST00000410913 300 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SLC8A1-AS1-203ENST00000418854 545 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 Z68871.1-201ENST00000426528 1133 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 FAF2P1-201ENST00000429974 1298 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MTRF1-204ENST00000430347 557 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MRLN-202ENST00000430431 495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL355483.4-201ENST00000432653 470 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC01827-201ENST00000432711 555 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AP001595.1-201ENST00000435878 516 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC244102.1-201ENST00000437309 848 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AP1B1P1-202ENST00000448124 191 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RN7SL77P-201ENST00000473332 294 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC055758.2-202ENST00000482351 624 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 HNRNPA1P44-201ENST00000503999 879 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC098679.2-201ENST00000513067 365 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC011379.2-201ENST00000523154 583 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AP002383.5-201ENST00000542623 1161 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZNF771-203ENST00000564550 1187 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RN7SL123P-201ENST00000577239 292 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC098850.2-201ENST00000578710 686 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RN7SL203P-201ENST00000579600 296 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC005197.1-201ENST00000597769 683 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC006115.1-201ENST00000599726 517 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC093458.1-201ENST00000608912 222 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 RFPL3S-206ENST00000621921 433 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC027176.3-201ENST00000624460 586 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC008537.3-201ENST00000623128 1881 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC00467-201ENST00000423222 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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