Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC61Q9Y6R9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms