Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIC4Q9Y696 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLIC4Q9Y696 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms