Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX8Q9Y5X2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms