Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms