Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms