Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOD1Q9Y239 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOD1Q9Y239 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms