Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAK1Q9UPV9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms