Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTF2Q9UNY4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms