Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX7Q9UNH6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNX7Q9UNH6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms