Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms