Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNRGQ9UMZ2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms