Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPCN1Q9ULQ1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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