Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PNMA3Q9UL41 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA3Q9UL41 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms