Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRNDQ9UKY0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRNDQ9UKY0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms