Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms