Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms