Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMGXB4Q9UGU5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms