Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CFDP1Q9UEE9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CFDP1Q9UEE9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CFDP1Q9UEE9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CFDP1Q9UEE9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CFDP1Q9UEE9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms