Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX3Q9UBR4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX3Q9UBR4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms