Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RRBP1Q9P2E9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms