Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHD7Q9P2D1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms