Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK12Q9NYV4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms