Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms