Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TOR4AQ9NXH8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms