Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4L1Q9NU39 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms