Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CENPMQ9NSP4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CENPMQ9NSP4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms