Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms