Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL3Q9H2J4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL3Q9H2J4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms