Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC113Q9H0I3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC113Q9H0I3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms