Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM5Q9C035 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms