Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFT27Q9BW83 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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