Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM42Q9BTD8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms