Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIOK1Q9BRS2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIOK1Q9BRS2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms