Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBA1CQ9BQE3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms