Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD5Q99666 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD5Q99666 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms