Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAT1Q99536 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAT1Q99536 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms