Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A9Q96Q91 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms