Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP4Q96PP9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms