Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM227BQ96M60 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms