Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIC2Q96JB3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms