Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms