Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCC12Q96J65 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCC12Q96J65 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms