Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX11Q96FC9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX11Q96FC9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms