Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC10A4Q96EP9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms