Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RSPRY1Q96DX4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms