Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRC39Q96DD0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRC39Q96DD0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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