Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms